（1）生物安全柜
生物安全柜是为操作原代培养物、菌毒株以及诊断性标本等具有感染性的实验材料时，用来保护操作者本人、实验室环境以及实验材料，使其避免暴露于上述操作过程中可能产生的感染性气溶胶和溅出物而设计的。
（2）高压蒸汽灭菌锅
高压蒸汽灭菌锅是个密闭的、可以耐受定压力的双层金属锅。锅层或夹层内盛水，当水在锅内沸腾时由于蒸汽不能逸出，使锅内压力逐渐升高，水的沸点和温度可随之升高，从而达到高温灭菌的目的。般在0.11MPa的压力下，121℃灭菌20-30分钟，包括芽孢在内的所有微生物均可被杀死。如果灭菌物品体积较大，蒸汽穿透困难，可以适当提高蒸汽压力货延长灭菌时间。
（3）培养箱
培养箱是培养微生物的专用设备。制热式培养箱是由电炉丝和温度控制仪合成的固定体积的恒温培养装置，大小规格不。微生物实验室常用的培养箱工作容积有70L或150，适用于室温至60℃之间的各类微生物培养。
（4）干燥箱
干燥箱是用于出去潮湿物内及器皿内外水分或其它挥发性溶液的设备。类型很多，有箱式、滚筒式、套间式等。微生物学实验室多用箱式干燥箱，大小规格不。
（5）微生物显微镜
微生物个体微小，必须借助显微镜才能观察清楚它们的个体形态和细胞结构。因此，在微生物学的各项研究中，显微镜就成为不可缺少的工具。
显微镜的种类很多，根据其结构，可以分为光学显微镜和非光学显微镜两大类。简单的单式显微镜即放大镜（放大倍数常在10倍左右），构造复杂的单式显微镜为解剖显微镜（放大倍数在200左右）。在微生物学的研究中，主要是复式显微镜。其中以普通光学显微镜（明视野显微镜）为常用。
（6）摇床
摇床又称摇瓶机，它是培养好气性微生物的小型试验设备或作为种子扩大培养之用，常用的摇床有往复式和旋转式两种。往复式摇床的往复频率般在80-140次/分钟，冲程般为5-14厘米，如频率过快、冲程过大或瓶内液体装量过多，在摇动时液体会溅到包扎瓶口的纱布或棉塞上，导致杂菌污染，特别是启动时更容易发生这种情况。
（7）均质机
食品加工中的均质机的应用：食品加工中的均质机是指将物料的料液在挤压、强冲击与失压膨胀的三重作用下使物料细化，从而使物料能更均匀的相互混合，比如奶制品加工中使用均质机使牛奶中的脂肪破碎的更加细小，从而使整个产品体系更加稳定。牛奶会看起来更加洁白。均质主要通过均质机来进行的。是食品、乳品、饮料的行业的重要加工设备。
除了以上常用设备，实验室还会用到分光光度计、水浴锅、PH计、离心机、快速检测设备、常用玻璃仪器等。
